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计算机技术2020年23期

基于云计算与弹性计算的基因组预测分析系统
么贺贵¹,高云燕²,姜驿¹,王金豹¹,唐友¹’³
(1. 吉林农业科技学院 电气与信息工程学院,吉林 吉林 132101;2. 吉林农业科技学院 经济管理学院,吉林 吉林 132101; 3. 吉林农业科技学院 智慧农业工程研究中心,吉林 吉林 132101)

摘  要:该项目以云计算与弹性计算为实践方法,基于多种平台架构,对基因组预测分析系统进行开发设计。采用MySQL数据库,通过Apache 构建平台,使用阿里云计算推出的弹性计算云服务器,运用Java Web 来实现基因组预测分析功能。项目遵循软件工程生命周期,从需求分析、数据库设计等多方面进行详细阐述,全面介绍了基因组预测分析的全过程,具有计算准确度高,页面操作难度低,结果可视化等多个优点,能够为用户提供良好的云计算服务。


关键词:云计算;弹性计算;WebServer 架构



中图分类号:TP311.52;R394         文献标识码:A        文章编号:2096-4706(2020)23-0076-04


Genome Prediction and Analysis System Based on Cloud Computing and

Elastic Computing

MO Hegui1,GAO Yunyan2,JIANG Yi1,WANG Jinbao1,TANG You1,3

(1.Electrical and Information Engineering College,Jilin Agricultural Science and Technology University,Jilin 132101,China;2.Economic and Management School,Jilin Agricultural Science and Technology University,Jilin 132101,China;3.Smart Agricultural Engineering Research Center,Jilin Agricultural Science and Technology University,Jilin 132101,China)

Abstract:This project takes cloud computing and elastic computing as the practical methods,and develops and designs the genome prediction analysis system based on various platform architectures. The MySQL database is used to build the platform through Apache,the elastic computing cloud server launched by Alibaba cloud computing is used to realize the function of genome prediction and analysis by using Java Web. The project follows the life cycle of software engineering,elaborates on the requirements analysis,database design and other aspects,and comprehensively introduces the whole process of genome prediction and analysis. It has many advantages,such as high accuracy of calculation,low difficulty of page operation,and visualization of results. It can provide users with good cloud computing services.

Keywords:cloud computing;elastic computing;WebServer architecture


基金项目:吉林省大学生科技创新创业训练计划项目(〔2020〕003)


参考文献:

[1] 吴浩宇. 基于Hadoop 的同源性搜索GO 功能注释平台的研究 [D]. 南京:南京农业大学,2013.

[2] EKANAYAKE J,GUNARATHNE T,QIU J. CloudTechnologies for Bioinformatics Applications [J].IEEE Transactions onParallel and Distributed Systems,2011,22(6):998-1011

[3] 王小磊,李江域,毛逸清,等. 利用Galaxy 与高性能计算集群构建本地化一站式生物信息学平台 [J]. 军事医学,2013,37(10):780-783.

[4] 王秋文. 基于Hadoop 的全基因组关联研究系统设计与实现 [D]. 天津:天津大学,2012.

[5] 唐友. 基于全基因组测序的表型预测方法研究及其体系构建 [D]. 哈尔滨:东北农业大学,2017.


作者简介:

么贺贵(2000—),男,汉族,河北唐山人,本科在读,研究方向:Web 前端;

通讯作者:

唐友(1979—),男,汉族,黑龙江哈尔滨人,系统架构师,教授,博士,主要研究方向:计算机科学、生物信息学、遗传统计。